本館座落於臺北市市中心，館舍面積約為 5,497 平方公尺（ 1,665.75 坪），共分四個樓層，各樓層資料存放與服務區說明如下：

　　本館館藏旨在支援及配合本校醫學校區之教學、研究與醫療服務，以健康科學（Health Sciences）相關資料為主要蒐藏範圍，且以心理學、生物學、化學、人類學、社會學、環境科技、教育等學科中與健康科學相關之主題為輔。蒐藏之資料類型包括圖書、期刊、視聽資料及電子資源等，目前圖書及期刊館藏量均已達十一萬冊以上。

1. 閱覽流通服務：包括圖書及非書資料之借閱、歸還、預約、續借及借書證與閱覽證之辦理。
2. RFID自助借還書系統：借還書DIY，不必等候！自助還書系統24小時連線，可即時完成還書手續，提供快速便捷的流通服務。
3. 館際合作服務：提供國內外圖書互借與期刊複印申請服務。
4. 院內期刊代印服務：辦理本校專任講師以上之教師申請影印本校期刊館藏資料。
5. 校內圖書代借服務：提供本校現任教職員工及在學學生申請跨校區之圖書代借服務。
6. 校外人士文獻傳遞服務： 提供本校畢業校友、開業醫生、藥商個人及有研究興趣者文獻複印暨傳遞服務。
7. 複印服務：提供影印機以影印圖書及期刊資料。
8. 教師指定參考書：陳列當學期開課教師之指定參考書以方便學生利用。
9. 核心館藏：陳列各科圖書委員所建議之核心教科書。
10. 師長推薦圖書區：定期展示由各學科師長推薦之館藏圖書，並附有相關介紹資料。
11. 醫學人文圖書：陳列臺灣醫療史、臺灣醫界人物傳記、醫學校區發展歷史、醫學與人文相關主題圖書，該區圖書限館內閱覽。
12. 休閒圖書區：提供讀者在獲取專業資訊之餘，亦有一處紓解壓力的圖書與空間。
13. 參考諮詢服務：由參考館員對讀者提出之問題做詳細之回覆。
14. 電子資源檢索服務：讀者可自行檢索各種書目式資料庫、全文資料庫、線上電子書以及生物醫學相關全文電子期刊、醫學網路資源等；另外，讀者亦可付費委託館員代為進行主題檢索。
15. 圖書館利用指導：為了讓讀者對本館能有全盤的認識，特設計了一套圖書館利用指導講習課程，分成圖書館引導參觀、圖書館書目指導及光碟資料庫與網路資源講習三種層次，每學期皆會定期及不定期舉辦多場講習課程。
16. 電腦與網路使用相關服務：
• 文書處理軟體之使用。
• 書目資料與全文資料之列印，以及文件資料列印服務。
• 提供電腦設備供讀者使用學術網路及查詢圖書館線上公用目錄。
• 蒐集及整理網路資訊資源供讀者參考閱讀。
17. 影像處理系統服務：提供中、西文文字辨識系統、影像處理系統、掃描器及彩色雷射印表機以供讀者掃描或列印文件、圖片、幻燈片、透明片、 X 光片及 35mm 正負片等資料。
18. 視聽資料暨設備之借用：本館備有 2,900 多種各式媒體之醫學視聽資料，並提供錄放影機、幻燈機及影碟機等設備以資使用。
19. 研究小間借用服務：提供研究小間以便個人進行學術研究之用。
20. 討論室借用服務：提供團體討論或合作研究之使用。
21. 視聽室借用服務：可容納6至10人之空間，備有錄放影機、電視機、DVD光碟機等視聽器材設備，亦可作為小組討論教學或觀看視聽資料之用。
22. 簡報室借用服務：作為進行電腦上機教學之場所。
23. 會議室借用服務：提供投影機、投射布幕，可容納20人進行會議或團體討論，並且免費提供給校區內其他單位（含學生社團）申請使用。
24. 專題視聽播放服務：為有系統介紹與推廣本館收藏之醫學相關錄影帶、DVD光碟片及電腦軟體等形式之視聽資料，本館特提供專題式播放服務，並結合本館新進視聽館藏與有線電視醫學人文頻道，以延伸讀者對該學科之知識領域。
25. 新知展示：不定期商請廠商到館舉辦新式媒體說明會。
26. 醫學校區教職員著作資料庫：本館蒐集並建置教職員著作資料庫，以供讀者檢索查詢。

1. 本館每年定期出版館訊六期，除提供讀者圖書館服務之最新消息外，亦刊登館藏介紹、本館動態及特載文章，實為一有價值之資訊管道。
2. 為使讀者更快速獲得本館舉辦的活動、服務項目與資源利用等資訊，特於每月10號出版「臺大醫圖電子報」，歡迎讀者多加訂閱或上網瀏覽。
3. 印製各式服務之單張簡介資料及各類型讀者使用指引，同時將本館相關資料放置於本館首頁上，以提供讀者查詢。
4. 出版「臺灣大學醫學院圖書分館館藏發展政策暨醫學圖書與期刊核心選目」及「臺灣地區醫學圖書館統計」。
5. 為能讓圖書館與讀者長相左右，本館陸續製作多種深具創意與巧思的紀念品供讀者選購，如：紀念衫、紀念筆、馬克杯、鑰匙圈、背包等醫圖紀念品。